Ответ:

Причастие согласуется со словом «популяций» — женский род, множественное число, родительный падеж: «населяющих». Оборот стоит после определяемого слова и выделяется запятыми.

Группа популяций разных видов, населяющих определённую территорию, образует сообщество.