Выбираем между 'are' и 'do'. Вопрос содержит глагол 'reading now', что указывает на Present Continuous. Для образования вопросов в Present Continuous используется глагол 'to be'. Так как подлежащее 'they' (мн.ч.), используем 'are'.
Ответ: What are they reading now?