В утвердительных предложениях с Present Perfect для обозначения того, что действие уже произошло (часто раньше, чем ожидалось), используется слово 'already'. Слово 'yet' используется в отрицаниях и вопросах.
Поскольку предложение является утвердительным и выражает факт, что обед уже состоялся, используется 'already'.
Ответ: We've already had lunch, thank you.