Отличие, прежде всего, заключается в масштабе и организации. Биосистема «организм» относится к живой природе (растение, животное и т.д.) и характеризуется организацией на уровне клеток, тканей, органов и систем, которые взаимодействуют между собой и функционируют, чтобы поддерживать жизнедеятельность организма. Система «горы Кавказа» более крупная и сложная, включает в себя различные биологические виды, геологические структуры, климатические условия и прочие аспекты.
Процесс развития биосистемы «организм», которая входит в состав другой системы, движется постепенно и поэтапно, проходя стадии от клетки до полноценного взрослого организма. Завершается все старением – наступлением регресса, когда нарушается работа системы. Система «горы Кавказа» формируются в течение многих геологических процессов и долгих десятилетий. После завершения формирования она образует собственную биосистему, но не регрессирует (меняться может только стареющая экосистема).