1) Красные, желтые и рыжие листья качались на синей воде озера. Однородные определения. Запятые расставлены верно.
2) Погода была чудная, солнечная, тихая, с бодрящим свежим воздухом. Однородные определения. Запятые расставлены верно.
3) И дождь, и туман, и тучи все перемешалось между собой. Однородные подлежащие, соединенные повторяющимся союзом «и». Запятые ставятся между однородными членами, если они не соединены союзом.
4) Ничего не дается само собой без усилий и воли. Однородные дополнения (усилий, воли) соединены союзом «и». Запятая не ставится.
5) Ранним утром лес свежий, тихий, таинственный. Однородные определения. Запятые расставлены верно.
Ответ: 1, 2, 5