Для ответа на вопрос необходимо заполнить пропуск в предложении, чтобы получился вопрос в Present Perfect Tense.
Вспомним структуру Present Perfect:
Вопросительное предложение: Has/Have + подлежащее + V3 (Past Participle)?
В данном случае подлежащее - he, значит, вспомогательный глагол has использован верно.
V3 (Past Participle) глагола "to study" - studied.
Следовательно, пропущенное слово - studied.
What languages has he studied?
Какие языки он изучал?
Ответ: studied