Ответ:

Правильный вариант — Министерство природных ресурсов РФ (в современной системе органов власти — Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации). Оно формирует государственную политику и осуществляет нормативно-правовое регулирование в сфере использования и охраны водных объектов. Остальные варианты не являются главным органом управления в этой сфере.

Ответ: Министерство природных ресурсов РФ.