why has to get up early? — Вопросительное предложение, поэтому используется вспомогательный глагол do/does. В данном случае does, так как подлежащее 'he' в 3-м лице единственного числа.
They have to get up early. — В данном случае 'they' — это подлежащее, поэтому вспомогательный глагол do используется для образования отрицания или вопроса, но здесь это утвердительное предложение, где 'they' выступает в роли подлежащего.