I knew he ______ because his eyes were red.

Для того чтобы правильно выбрать пропуск, нужно понять, какой временной период имеется в виду. Фраза «his eyes were red» указывает на прошлое. Давайте разберем варианты:

• A. cried — это Past Simple. Он мог заплакать в какой-то момент в прошлом, но это не объясняет, почему глаза были красными прямо сейчас (относительно момента речи, который уже в прошлом).
• B. was crying — это Past Continuous. Это означает, что действие (плач) происходило в течение какого-то времени в прошлом. Это хорошо сочетается с тем, что глаза были красными.
• C. had cried — это Past Perfect. Используется, когда одно прошедшее действие произошло раньше другого прошедшего действия. Здесь это возможно, но Past Continuous звучит более естественно для описания причины состояния.
• D. had been crying — это Past Perfect Continuous. Используется для подчеркивания длительности действия в прошлом, которое привело к результату. Это самый подходящий вариант, так как он явно указывает на то, что плач был длительным и именно он вызвал красные глаза.

В данном случае, как Past Continuous, так и Past Perfect Continuous могут быть грамматически верны, но Past Perfect Continuous (had been crying) лучше передает причинно-следственную связь: длительный плач привел к красноте глаз.

Ответ: D. had been crying